發酵技術國家工程研究中心（簡稱：工程中心）是由國家發改委批準，由豐原集團、天津大學、江南大學和中科院等離子所共同出資建立的國家多部委認可的發酵技術工程研究中心。工程中心的主要職責是開展菌種技術、發酵技術、分離提取技術、環保處理技術等方面的研究，承擔了生物基化學品生物煉制、秸稈生物法制乙醇、自絮凝酵母清液生產乙醇等多項國家863計劃項目和省級重點攻關項目。 

工程中心自2003年成立以來，先后承擔了國家十一五科技支撐計劃項目、國家十二五科技支撐計劃項目、國家“863”計劃以及省科技攻關計劃等，取得了多項優異成果，包括秸稈纖維素轉化利用技術，多種有機酸類、氨基酸類、維生素類和生物基材料等產品的生產技術，已取得或在申請重大方法專利技術180多項，主持或參與制定國家標準、行業標準30多項。其中秸稈纖維素制乙醇技術被列入國家科技支撐計劃，進入安徽省省部會商機制，5000t/年秸稈纖維素制乙醇產業化示范線通過了省發改委組織的專家論證；省科技攻關項目“以玉米芯為原料生產L-乳酸產業化技術”建成1000t/年產業化示范線并通過了科技廳組織的專家鑒定。 

在工程技術產業化方面，工程中心多項技術已應用到集團新項目中，其中一步發酵法L-蘋果酸技術實現國內零的突破，完成國內首條發酵法L-蘋果酸生產示范線建設，產品質量和指標優于石油路線和國外企業，解決了長期以來國內只能以石油路線生產DL-蘋果酸或石油路線酶轉化法生產L-蘋果酸的局限，正在實施3萬噸/年發酵法L-蘋果酸產業化項目。